В соответствии со статьей 8 Соглашения между Правительством Российской Федерации и Правительством Литовской Республики о долгосрочном сотрудничестве Калининградской области РФ и регионов ЛР от 29 июня 1999 года создан Российско–Литовский совет по долгосрочному сотрудничеству между региональными и местными властями Калининградской области РФ и ЛР.
Согласно Положению Совет состоит из российской и литовской частей, создаваемых на паритетных началах. Национальные части совета возглавляю председатели, которые информирует друг друга о персональном составе своих частей совета и их последующих изменениях.
В Совете российскую сторону представляют: сопредседатель – губернатор Калининградской области Н.Н. Цуканов, заместитель сопредседателя – Министр - руководитель Агентства по международным и межрегиональным связям А.Г.Иванова, ответственный секретарь, руководители комиссий и, по согласованию, представители МИД РФ, Минэкономразвития РФ.
Литовскую часть Совета возглавляет Вице-министр иностранных дел Литвы г-н А. Кривас.
Совет определяет и координирует общие направления, программы и формы долгосрочного сотрудничества между региональными и местными властями Калининградской области и Литовской Республики, а также занимается практическими вопросами приграничного взаимодействия.
Совет состоит из 9 комиссий:
В 24-25 апреля 2012 года в Калининграде состоялось восьмое заседание Российско-Литовского совета по долгосрочному сотрудничеству между региональными и местными властями Калининградской области Российской Федерации и Литовской Республики. В ходе заседания обсуждались вопросы двустороннего взаимодействия в сфере торгово-экономического сотрудничества, экологии. Сторонами была также отмечена необходимость развития и модернизации транспортной и приграничной инфраструктуры.